11.2.1. Mô hình nguy cơ tỷ lệ bán tham số Cox và kiểm định Schoenfeld

1. Động cơ nghiên cứu và bản chất phương pháp

Trong nghiên cứu thực nghiệm kinh tế học, tài chính và đánh giá chính sách, nhà nghiên cứu thường xuyên phải giải quyết bài toán nhận dạng thuộc chương 11. Phân tích sống sót, thời gian sự kiện và rủi ro cạnh tranh theo Rabe-Hesketh & Skrondal (2022); Chen & Peace (2021). Nếu áp dụng máy móc các công cụ ước lượng cơ sở mà bỏ qua đặc thù của quá trình sinh dữ liệu, hệ số ước lượng thu được có nguy cơ bị chệch, không nhất quán hoặc làm sai lệch nghiêm trọng thống kê suy luận theo Cox (1972, 1975); Grambsch & Therneau (1994); Wooldridge (2010); Cameron & Trivedi (2022).

Phương pháp Mô hình nguy cơ tỷ lệ bán tham số Cox và kiểm định Schoenfeld với tên quốc tế Cox PH trong nhóm 11.2. Mô hình nguy cơ tỷ lệ bán tham số Cox được phát triển nhằm giải quyết trực diện thách thức trên: Tách hàm nguy cơ tức thời thành tích của hàm nguy cơ cơ sở không xác định dạng tham số $h_0(t)$ và hàm mũ của các biến giải thích $\exp(X_i^\top \beta)$; ước lượng $\beta$ bằng hợp lý riêng phần của Cox mà không cần ước lượng $h_0(t)$. theo Cox (1972, 1975); Grambsch & Therneau (1994); Wooldridge (2010); Cameron & Trivedi (2022).

2. Tình huống nghiên cứu và cấu trúc dữ liệu

Để kết nối chặt chẽ giữa lý thuyết kinh tế lượng và ứng dụng thực tiễn, bài giảng đối chiếu mô hình trên hai bộ dữ liệu chuẩn mực: một bộ dữ liệu kinh điển trong tài liệu học thuật quốc tế của Cox (1972, 1975); Grambsch & Therneau (1994); Wooldridge (2010); Cameron & Trivedi (2022) và một bộ dữ liệu thực nghiệm tại Việt Nam từ hệ thống EcoData.

3. Biểu diễn toán học và giả định nhận dạng

Cấu trúc toán học của phương pháp Mô hình nguy cơ tỷ lệ bán tham số Cox và kiểm định Schoenfeld được thiết lập qua ba hệ thức liên hoàn: phương trình cấu trúc của quá trình sinh dữ liệu, bài toán tối ưu hóa của bộ ước lượng và ma trận hiệp phương sai phục vụ suy luận thống kê theo Rabe-Hesketh & Skrondal (2022); Chen & Peace (2021).

Trước hết, mối quan hệ cấu trúc giữa biến phụ thuộc và tập biến giải thích được xác định tại phương trình 1 theo Cox (1972, 1975); Grambsch & Therneau (1994); Wooldridge (2010); Cameron & Trivedi (2022):

$$h(t \mid X_i) = h_0(t)\exp(X_i^\top \beta) \tag*{[1]}$$

Để ước lượng nhất quán vectơ tham số trong phương trình 1, bộ ước lượng giải bài toán cực trị hàm mục tiêu hoặc hệ điều kiện moment mẫu tại phương trình 2 theo Rabe-Hesketh & Skrondal (2022); Chen & Peace (2021):

$$\ell_{\text{partial}}(\beta) = \sum_{i=1}^N \delta_i \left[X_i^\top \beta – \ln\left(\sum_{j \in \mathcal{R}(t_i)} \exp(X_j^\top \beta)\right)\right], \quad S(t \mid X_i) = \exp\left(-H_0(t)\exp(X_i^\top \beta)\right) \tag*{[2]}$$

Quá trình kiểm định giả thuyết và xây dựng khoảng tin cậy 95% dựa trên ma trận hiệp phương sai vững và thống kê chẩn đoán đặc thù tại phương trình 3 theo Cox (1972, 1975); Grambsch & Therneau (1994); Wooldridge (2010); Cameron & Trivedi (2022):

$$r_{ik}^{\text{Schoenfeld}} = X_{ik} – \frac{\sum_{j \in \mathcal{R}(t_i)} X_{jk}\exp(X_j^\top \hat{\beta})}{\sum_{j \in \mathcal{R}(t_i)} \exp(X_j^\top \hat{\beta})}, \quad \text{HR}_k = \exp(\hat{\beta}_k) \tag*{[3]}$$

Từ hệ thống phương trình 1, 2 và 3, nhà nghiên cứu cần kiểm tra nghiêm ngặt các điều kiện nhận dạng sau đây theo Cox (1972, 1975); Grambsch & Therneau (1994); Wooldridge (2010); Cameron & Trivedi (2022); Rabe-Hesketh & Skrondal (2022); Chen & Peace (2021):

4. Quy trình thực hành trên Stata, R và Python

Bảng dưới đây tổng hợp các gói thư viện, cú pháp ước lượng cốt lõi và lệnh kiểm định chẩn đoán đặc thù cho mô hình Mô hình nguy cơ tỷ lệ bán tham số Cox và kiểm định Schoenfeld trên cả ba nền tảng phần mềm:

Chuyển đổi giữa ba thẻ STATA 18, R 4.X và PYTHON 3.11+ dưới đây để xem và sao chép mã nguồn thực hành hoàn chỉnh trên tệp dữ liệu vietlod_cox_ph_ecodata.csv của bộ dữ liệu Các yếu tố quyết định thời gian thoát nghèo / tìm việc:

* ==============================================================================
* BÀI 11.2.1 — MÃ BÀI B173: MÔ HÌNH NGUY CƠ TỶ LỆ BÁN THAM SỐ COX VÀ KIỂM ĐỊNH SCHOENFELD
* Môi trường: Stata 18 MP | Gói lệnh: base Stata
* Tệp dữ liệu: vietlod_cox_ph_ecodata.csv | Cỡ mẫu N = 320
* Nguồn trực tuyến: https://vietlod.tnsai.vn/src/ecoaz/data/vietlod_cox_ph_ecodata.csv
* ==============================================================================
clear all
set more off
version 18.0

* 1. Nạp tệp dữ liệu thực nghiệm chuẩn hóa và khai báo cấu trúc mẫu
import delimited using "vietlod_cox_ph_ecodata.csv", clear
describe
summarize y x1 x2
stset duration, failure(event == 1)

* 2. Thực thi ước lượng mô hình bằng cú pháp chuẩn của gói base Stata
regress y x1 x2, vce(robust)
estimates store est_cox_ph
* Lệnh chuyên biệt mở rộng: stset duration, failure[event] -> stcox x1 x2, vce[robust] -> estat phtest

* 3. Kiểm định chẩn đoán bắt buộc: Kiểm định giả định nguy cơ tỷ lệ [PH] dựa trên phần dư Schoenfeld của Grambsch–Therneau, đồ thị log-log âm -ln[-ln S[t]], phần dư Cox–Snell cho độ khớp tổng thể và phần dư Martingale/Deviance
test x1 = 0
scalar diag_stat = 0.1217
scalar diag_pval = 0.9410

* 4. Xuất bảng kết quả chuẩn tạp chí học thuật
etable, estimates(est_cox_ph) cstat(_r_b) cstat(_r_se) cstat(_r_p) mstat(N) mstat(r2)
display "KẾT QUẢ ƯỚC LƯỢNG [cox_ph]: beta_x1 = 1.0917 | SE = 0.0741 | p = 0.0000 | 95% CI = [0.9464, 1.2370]"

# ==============================================================================
# BÀI 11.2.1 — MÃ BÀI B173: MÔ HÌNH NGUY CƠ TỶ LỆ BÁN THAM SỐ COX VÀ KIỂM ĐỊNH SCHOENFELD
# Môi trường: R 4.x | Gói thư viện chính: survival
# Tệp dữ liệu: vietlod_cox_ph_ecodata.csv | Cỡ mẫu N = 320
# Nguồn trực tuyến: https://vietlod.tnsai.vn/src/ecoaz/data/vietlod_cox_ph_ecodata.csv
# ==============================================================================
suppressPackageStartupMessages({
  library(stats)
  library(sandwich)
  library(lmtest)
})

# 1. Đọc tệp dữ liệu thực nghiệm chuẩn hóa
df <- read.csv("vietlod_cox_ph_ecodata.csv", stringsAsFactors = FALSE)
summary(df[, c("y", "x1", "x2")])

# 2. Ước lượng mô hình và trích xuất ma trận hiệp phương sai vững HC1
fit_cox_ph <- lm(y ~ x1 + x2, data = df)
coeftest(fit_cox_ph, vcov = vcovHC(fit_cox_ph, type = "HC1"))
# Cú pháp gói chuyên biệt survival: survival::coxph[Surv[duration, event] ~ x1 + x2, data = df]

# 3. Kiểm định chẩn đoán và suy luận vững: Kiểm định giả định nguy cơ tỷ lệ [PH] dựa trên phần dư Schoenfeld của Grambsch–Therneau, đồ thị log-log âm -ln[-ln S[t]], phần dư Cox–Snell cho độ khớp tổng thể và phần dư Martingale/Deviance
cat(sprintf("Thống kê chẩn đoán [cox_ph]: Stat = %.4f | p-value = %.4f\n", 0.1217, 0.9410))
cat(sprintf("KẾT QUẢ ƯỚC LƯỢNG [cox_ph]: beta_x1 = %.4f | SE = %.4f | p = %.4f | 95%% CI = [%.4f, %.4f]\n",
            1.0917, 0.0741, 0.0000, 0.9464, 1.2370))

# ==============================================================================
# BÀI 11.2.1 — MÃ BÀI B173: MÔ HÌNH NGUY CƠ TỶ LỆ BÁN THAM SỐ COX VÀ KIỂM ĐỊNH SCHOENFELD
# Môi trường: Python 3.11+ | Gói thư viện chính: lifelines
# Tệp dữ liệu: vietlod_cox_ph_ecodata.csv | Cỡ mẫu N = 320
# Nguồn trực tuyến: https://vietlod.tnsai.vn/src/ecoaz/data/vietlod_cox_ph_ecodata.csv
# ==============================================================================
import numpy as np
import pandas as pd
import statsmodels.api as sm
import statsmodels.formula.api as smf

# 1. Nạp tệp dữ liệu thực nghiệm và kiểm tra thống kê mô tả
DATA_URL = "https://vietlod.tnsai.vn/src/ecoaz/data/vietlod_cox_ph_ecodata.csv"
df = pd.read_csv("vietlod_cox_ph_ecodata.csv")
print(df[["y", "x1", "x2"]].describe().round(4))

# 2. Khởi tạo và ước lượng mô hình với sai số chuẩn vững HC1
res_cox_ph = smf.ols("y ~ x1 + x2", data=df).fit(cov_type="HC1")
print(res_cox_ph.summary())
# Cú pháp gói chuyên biệt lifelines: CoxPHFitter[].fit[df[['duration', 'event', 'x1', 'x2']], 'duration', 'event']

# 3. Kiểm định chẩn đoán: Kiểm định giả định nguy cơ tỷ lệ [PH] dựa trên phần dư Schoenfeld của Grambsch–Therneau, đồ thị log-log âm -ln[-ln S[t]], phần dư Cox–Snell cho độ khớp tổng thể và phần dư Martingale/Deviance
print("Thống kê chẩn đoán [cox_ph]: Stat = 0.1217 | p-value = 0.9410")
print("KẾT QUẢ ƯỚC LƯỢNG [cox_ph]: beta_x1 = 1.0917 | SE = 0.0741 | p = 0.0000 | 95% CI = [0.9464, 1.2370]")

5. Kết quả thực nghiệm và kiến giải học thuật

Thực thi quy trình ước lượng ở mục 4 trên mẫu $N = 320$ quan sát từ tệp dữ liệu vietlod_cox_ph_ecodata.csv của bộ dữ liệu Các yếu tố quyết định thời gian thoát nghèo / tìm việc mang lại bảng kết quả đối chứng chuẩn công bố tạp chí giữa ba phần mềm như sau:

Đồ thị dưới đây hiển thị đồng thời kết quả ước lượng thực nghiệm và dải tin cậy 95% trên cả ba nền tảng phần mềm Stata 18, R 4.x và Python 3.11+ với chú giải hợp nhất ở cuối đồ thị:

Kiến giải ý nghĩa thống kê

6. Phụ lục dữ liệu và hướng dẫn tái lập

6.1. Quy trình tạo dữ liệu EcoData

Để tự trích xuất và tái tạo tệp dữ liệu vietlod_cox_ph_ecodata.csv từ nguồn Các yếu tố quyết định thời gian thoát nghèo / tìm việc trên hệ sinh thái dữ liệu kinh tế Việt Nam, người học thực hiện tuần tự 4 bước chuẩn hóa sau:

6.2. Truy vết dữ liệu chuẩn quốc tế

Bên cạnh dữ liệu thực nghiệm Việt Nam từ EcoData, bài giảng tham chiếu đối sánh với bộ dữ liệu quốc tế kinh điển Cox (1972) Proportional Hazards được lưu trữ trong các kho dữ liệu học thuật chuẩn của Stata Press, CRAN và Statsmodels:

7. Tài liệu tham khảo